La teología que se forjó antes del Concilio Vaticano II (1904-1961)
En 1904 el Seminario Pontificio de Comillas se convierte en universidad al poder otorgar grados en filosofía, teología y derecho canónico.
En 1931 la Constitución Apostólica Deus Scientiarum Dominus de Pío XI confirma definitivamente a Comillas como Universidad Pontificia. Entre 1940 y 1961 la universidad vive una época de plenitud en el desarrollo de los estudios de teología y derecho canónico.
Fortalecida ya la tarea docente para la formación sacerdotal, comienza una intensa y fructífera capacidad creadora produciendo los primeros textos propios de teología fundamental, dogmática, moral y derecho canónico. Los PP. Eduardo F. Regatillo, Lucio Rodríguez, Joaquín Salaverri, Camilo M. Abad, entre otros, comienzan a destacar por su incipiente producción teológica, histórica y canónica.
La estructura y el contenido siguen estando marcados por el método escolástico y la lengua latina según las directrices de la encíclica Aeterni Patris (1879) de León XIII. La Sacrae Theologiae Summa de los PP. Jesuitas en España y la Theologiae MoralisSumma del P. Marcelino Zalba son los manuales de teología más destacados.
A partir de 1959, mientras se va preparando el traslado a Madrid, comienza a abrirse lentamente una nueva forma de estudio y producción teológica en lengua vernácula y con nuevos métodos históricos y literarios (L. Alonso Schökel) que catalizará de forma definitiva el Concilio Vaticano II.